旷工可以扣除当天的工资。旷工的具体处罚由用人单位依法制定的规章制度规定。如果旷工严重违反了公司的规章制度，公司可以开除劳动者而无需支付经济补偿，但不能扣除劳动者已经工作天数的工资。
旷工3天算自动离职违法吗
这在法律上并无规定。员工旷工三天，虽不能算自动离职，不过单位是可以按照公司的规章制度辞退员工的，并且单位可以扣除员工部分奖励性待遇作为处罚，但是不得克扣员工工资。
连续旷工几天可以解除劳动关系，这个要有公司自身的规章制度才可以被仲裁接受和认定。并且，公司需要举证证明这个规章制度已经送达给了员工本人。
：《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条法律依据：：《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条
劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：
（一）在试用期间被证明不符合录用条件的；
（二）严重违反用人单位的规章制度的；
（三）严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；
（四）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；
（五）因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；
（六）被依法追究刑事责任的。
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